旗舰上的明侨潘和五带着众明人奋起反抗，将船上包括总督在内的西班牙人几乎尽数杀死，仅12名士兵死里逃生，随后驾船远走。 这两次事件后，马尼拉殖民当局慢慢开始煽动排明浪潮。 也就是在这样的一个原因下，1594年初，一支明人船队在福建官员带领下，载着士兵和武器到达马尼拉，接回3000名明人。 这完全可以看成是世界史上第一次救侨、护侨行动，本来可以记到世界历史记录里的……但后来由于种种原因，这一伟大的行为鲜为人知。如果不是汉唐集团的人乱翻资料……可能他们自己都不知道。 1603年，菲律宾岛又出现一则传闻：大明皇帝有意占领菲律宾以获取这里的黄金。 这一传闻源自一名在吕宋生活多年的木匠，他称吕宋有一机易山，“其上金豆自生”。 万历皇帝便信以为真，下令福建官员前去勘查。西班牙人本就对明政府颇为忌惮，何况菲岛明人众多，因此疑心大明想“开疆裂土”。 随着排明情绪渐浓，西菲当局欲迫害甚至屠杀明侨的意图越来越明显。 这一切最终导致了1603年的大屠杀。 1603年10月3日，不愿坐以待毙的明侨爆发大起义，但由于缺少武器和军事经验，他们仅坚持了41天。起义很快演变成一场大屠杀。 在当局的煽动和蒙骗下，包括土著、日侨在内的各方力量都参与到屠杀中。据统计，至少2万明侨在这次动乱中被杀。 大量屠杀明侨对菲律宾本土经济产生了致命的影响。 由于畏惧，明商们不敢来此地了。马尼来市场上的物资顿时开始匮乏、经济开始萧条。当局财政状况严重恶化，甚至需要借贷度日。 西班牙人忧心明人的商船不再到来，连带着，会令遥远的美洲受到波及。 让他们更大的恐惧是，他们担心明朝政府会进行报复。西菲当局紧急加强战备，但此时的军队士气低落，口粮严重不足。 当时殖民者们只能心惊肉跳地等待，马尼拉笼罩在绝望和萧条气氛中。 那时的西班牙驻菲律宾总督阿库尼亚一面做些表面工作，如部分发还明侨商人的财产，发动幸存者给国内写信，企图证明西班牙殖民者“清白”；一面派特使奎瓦携带致广东、福建两省巡抚和其他官员的函件。 他于1603年12月10日乘船前往澳门，并趁机刺探大明政府有否进攻菲律宾打算的军事情报。考虑到澳门的葡萄牙人对大明比较了解，阿库尼亚还写了几封信，详述明侨起义事件，并附上致大明官员函件的副本，让奎瓦分发给澳门的司令官、主教、在政务方面有着较大发言权的耶稣会教士等。 但葡萄牙人出于打击贸易竞争对手的考虑，始终未将函件转交大明方面。葡萄牙人非常在乎每一次屏蔽大明的机会……只有他们才是大明的老朋友。 直到奎瓦等人抵达澳门的消息传到漳州，有经常往来漳州和马尼拉的大明富商到澳门与其会见，答应把函件转交大明官员，设法动员明侨继续贸易。 奎瓦当时在澳门了解到，明朝政府已获悉屠杀事件，但全国平静，没有集结舰只进攻马尼拉的迹象。获得这个重要情报后，奎瓦购买了一批军事物资，于5月回到马尼拉。 事实上，尽管明朝当局了解了事件真相，但它一贯把移民国外的明侨视为贱民，因此仅写了一份《谕吕宋檄》，于1605年5月底、6月初由大明贸易船队中一名船主带到马尼拉，分交菲律宾总督、马尼拉最高法院和马尼拉大主教。 檄文未对屠杀行为进一步严加追究，只要西班牙殖民当局保证明侨今后生命财产的安全，并宣布对殖民者“不忍加诛”，“其海外戕杀姑不穷治”，要求西班牙方面“当思皇帝浩荡之恩，大明Ｍ.zｚｗＴwＸ.CＯｍ